Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E4F1Q66K89 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E4F1Q66K89 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms