Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROCCQ5TZA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROCCQ5TZA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CROCCQ5TZA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms