Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITSN1Q15811 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ITSN1Q15811 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITSN1Q15811 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITSN1Q15811 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITSN1Q15811 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ITSN1Q15811 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ITSN1Q15811 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ITSN1Q15811 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ITSN1Q15811 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITSN1Q15811 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
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