Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS1Q14651 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLS1Q14651 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS1Q14651 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms