Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SKP2Q13309 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKP2Q13309 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKP2Q13309 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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