Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTF3Q12996 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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