Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 AVT3YKL146W 2079 nt7.96□□□□□ -1.13
TY2B-BQ12491 APJ1YNL077W 1587 nt7.96□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 VAM7YGL212W 951 nt7.96□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 CKB2YOR039W 777 nt7.96□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 ENT2YLR206W 1842 nt7.94□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 YLF2YHL014C 1218 nt7.94□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 GDT1YBR187W 843 nt7.94□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 QRI1YDL103C 1434 nt7.93□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 YEH2YLR020C 1617 nt7.93□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 FRT1YOR324C 1809 nt7.93□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 YIL108WYIL108W 2091 nt7.93□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 GEP5YLR091W 882 nt7.92□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 TIF5YPR041W 1218 nt7.92□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 HEM14YER014W 1620 nt7.92□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 KEL1YHR158C 3495 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 SSK1YLR006C 2139 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 SER33YIL074C 1410 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 BUD8YLR353W 1812 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 YDL027CYDL027C 1263 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 MRL1YPR079W 1146 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 PRR1YKL116C 1557 nt7.91□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt7.9□□□□□ -1.14
TY2B-BQ12491 SAF1YBR280C 1914 nt7.9□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 CTF3YLR381W 2202 nt7.89□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 YLR317WYLR317W 435 nt7.89□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 HXT13YEL069C 1695 nt7.89□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 MRF1YGL143C 1242 nt7.89□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 APN1YKL114C 1104 nt7.89□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 MEU1YLR017W 1014 nt7.89□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 CCR4YAL021C 2514 nt7.89□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 ATP1YBL099W 1638 nt7.88□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 NOT3YIL038C 2511 nt7.88□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 SCS2YER120W 735 nt7.88□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 GAL10YBR019C 2100 nt7.87□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 DCI1YOR180C 816 nt7.87□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 GUA1YMR217W 1578 nt7.87□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 PRS1YKL181W 1284 nt7.87□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 ECM10YEL030W 1935 nt7.86□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 YOL131WYOL131W 327 nt7.86□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 LYS2YBR115C 4179 nt7.86□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 YNL134CYNL134C 1131 nt7.85□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 STB5YHR178W 2232 nt7.85□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 GPM3YOL056W 912 nt7.84□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 ATG14YBR128C 1035 nt7.84□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 YAP1802YGR241C 1707 nt7.84□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 PDH1YPR002W 1551 nt7.84□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 YPT32YGL210W 669 nt7.84□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt7.84□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 PEX22YAL055W 543 nt7.84□□□□□ -1.15
TY2B-BQ12491 SLX5YDL013W 1860 nt7.83□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 ACS2YLR153C 2052 nt7.83□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 PIF1YML061C 2580 nt7.83□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 CDC13YDL220C 2775 nt7.83□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 QDR1YIL120W 1692 nt7.82□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 NTH2YBR001C 2343 nt7.82□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 HSP31YDR533C 714 nt7.82□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 YML6YML025C 861 nt7.82□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 YNL057WYNL057W 333 nt7.82□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 YMR027WYMR027W 1413 nt7.82□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 NDE1YMR145C 1683 nt7.81□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 UTP18YJL069C 1785 nt7.81□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 ERG12YMR208W 1332 nt7.81□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 ENT5YDR153C 1236 nt7.81□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 MRPL39YML009C 213 nt7.81□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 PSH1YOL054W 1221 nt7.81□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 RSP5YER125W 2430 nt7.81□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 DBR1YKL149C 1218 nt7.8□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 LPL1YOR059C 1353 nt7.8□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 CAB1YDR531W 1104 nt7.79□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 YNK1YKL067W 462 nt7.79□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 SMF3YLR034C 1422 nt7.79□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 TYS1YGR185C 1185 nt7.79□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 SCO1YBR037C 888 nt7.79□□□□□ -1.16
TY2B-BQ12491 FPR2YDR519W 408 nt7.77□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 PUS6YGR169C 1215 nt7.77□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 NSG1YHR133C 876 nt7.76□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 SEC12YNR026C 1416 nt7.75□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 VMA13YPR036W 1437 nt7.75□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 BUD7YOR299W 2241 nt7.75□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 YDR514CYDR514C 1452 nt7.75□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 PRP2YNR011C 2631 nt7.75□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 PRM1YNL279W 1986 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 IDP1YDL066W 1287 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 MDG1YNL173C 1101 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 RPS19BYNL302C 435 nt7.74□□□□□ -1.17
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TY2B-BQ12491 GEX2YKR106W 1848 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 SKI2YLR398C 3864 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 YEF1YEL041W 1488 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 SPS19YNL202W 879 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 SWI1YPL016W 3945 nt7.74□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 DOA1YKL213C 2148 nt7.73□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 KIP2YPL155C 2121 nt7.73□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 ACP1YKL192C 378 nt7.73□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 YPR098CYPR098C 486 nt7.73□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 NSE5YML023C 1671 nt7.73□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 STF1YDL130W-A 261 nt7.72□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 YHR214WYHR214W 612 nt7.72□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 YAR066WYAR066W 612 nt7.72□□□□□ -1.17
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