Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 SNZ3YFL059W 897 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YGR176WYGR176W 348 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 PGA3YML125C 939 nt5.66□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF2Q12221 DAL82YNL314W 768 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 SNZ2YNL333W 897 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 PIN2YOR104W 849 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 KTR5YNL029C 1569 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 ATP1YBL099W 1638 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 PAP1YKR002W 1707 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 SRP101YDR292C 1866 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 ARP2YDL029W 1176 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 snR78snR78 87 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 MRPL13YKR006C 795 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 ELA1YNL230C 1140 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 YNR048WYNR048W 1182 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF2Q12221 STL1YDR536W 1710 nt5.65□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 RIO1YOR119C 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 SKN1YGR143W 2316 nt5.64□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF2Q12221 RRP1YDR087C 837 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 RPO26YPR187W 468 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 CLB1YGR108W 1416 nt5.64□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF2Q12221 SAC6YDR129C 1929 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 GYP1YOR070C 1914 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YFL042CYFL042C 2025 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 TRK2YKR050W 2670 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 RPS15YOL040C 429 nt5.63□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 RTT106YNL206C 1368 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 UGO1YDR470C 1509 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YEL074WYEL074W 339 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 NCS6YGL211W 1080 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YLL059CYLL059C 507 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 RDL2YOR286W 450 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 PET20YPL159C 762 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 PRE2YPR103W 864 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 PCL10YGL134W 1302 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 CHL4YDR254W 1377 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 SEC18YBR080C 2277 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 SUB2YDL084W 1341 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YHP1YDR451C 1062 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 TRP5YGL026C 2124 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YJR115WYJR115W 510 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 PGU1YJR153W 1086 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 PRP40YKL012W 1752 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 OAC1YKL120W 975 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 TFS1YLR178C 660 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 URE2YNL229C 1065 nt5.61□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF2Q12221 IMA2YOL157C 1770 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 NUD1YOR373W 2556 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 ASN1YPR145W 1719 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YIL092WYIL092W 1902 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 BNA5YLR231C 1362 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 KNH1YDL049C 807 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 IPI1YHR085W 1005 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 MRPL24YMR193W 777 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YNL194CYNL194C 906 nt5.6□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL131WYOL131W 327 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 CAR1YPL111W 1002 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 TEA1YOR337W 2280 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 DUG1YFR044C 1446 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 RPT1YKL145W 1404 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 TEF1YPR080W 1377 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 TEF2YBR118W 1377 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 IDP1YDL066W 1287 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 TAF4YMR005W 1167 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 SIT1YEL065W 1887 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 YNL247WYNL247W 2304 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF2Q12221 RGD1YBR260C 2001 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 HSF1YGL073W 2502 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 KEX2YNL238W 2445 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 MLC1YGL106W 450 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 JJJ3YJR097W 519 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 RSA3YLR221C 663 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 TEL2YGR099W 2067 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 TIM54YJL054W 1437 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 BPL1YDL141W 2073 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 YHR045WYHR045W 1683 nt5.57□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF2Q12221 CSC1YLR241W 2349 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 EAF5YEL018W 840 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 DAL3YIR032C 588 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 KEL1YHR158C 3495 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 ACF2YLR144C 2340 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 UTP7YER082C 1665 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 AIM17YHL021C 1398 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 DSE3YOR264W 1293 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 RSA4YCR072C 1548 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 DDC1YPL194W 1839 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 LSG1YGL099W 1923 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 STE13YOR219C 2796 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 RPT6YGL048C 1218 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 YGL072CYGL072C 360 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 YLR118CYLR118C 684 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 YLR317WYLR317W 435 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 ECM2YBR065C 1095 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 BAP2YBR068C 1830 nt5.55□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF2Q12221 PIF1YML061C 2580 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 AVO1YOL078W 3531 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 SSK1YLR006C 2139 nt5.54□□□□□ -1.52 RIP-Chip
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms