Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 ASN1YPR145W 1719 nt4.88□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 TRP5YGL026C 2124 nt4.88□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 MAL11YGR289C 1851 nt4.88□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 BIT2YBR270C 1638 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 FRE3YOR381W 2136 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 CST6YIL036W 1764 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 YDR401WYDR401W 564 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 MOG1YJR074W 657 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 PGA3YML125C 939 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 YNR048WYNR048W 1182 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 ATG7YHR171W 1893 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 MRK1YDL079C 1506 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 ATE1YGL017W 1512 nt4.87□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 FOL1YNL256W 2475 nt4.86□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 BPL1YDL141W 2073 nt4.86□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.86□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 OXP1YKL215C 3861 nt4.86□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 FAT3YKL187C 2253 nt4.86□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 DED81YHR019C 1665 nt4.86□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 SNT2YGL131C 4212 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 VMA16YHR026W 642 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 TIF2YJL138C 1188 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 TIF1YKR059W 1188 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 ZRT2YLR130C 1269 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 BRF1YGR246C 1791 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 IMA2YOL157C 1770 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 VPS72YDR485C 2388 nt4.85□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 SRP101YDR292C 1866 nt4.84□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 SHM1YBR263W 1473 nt4.84□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 UBC4YBR082C 447 nt4.84□□□□□ -1.63
TIR4Q12218 QDR1YIL120W 1692 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 VBA1YMR088C 1689 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 RPT1YKL145W 1404 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 CHL4YDR254W 1377 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 EEB1YPL095C 1371 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 DFM1YDR411C 1026 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 SWP1YMR149W 861 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YOR024WYOR024W 324 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 RDL2YOR286W 450 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YPL136WYPL136W 369 nt4.83□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 SYG1YIL047C 2709 nt4.82□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 SIT1YEL065W 1887 nt4.82□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 PRS2YER099C 957 nt4.82□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 DDC1YPL194W 1839 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 LYS21YDL131W 1323 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 GEP3YOR205C 1671 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YDL121CYDL121C 450 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 TRP1YDR007W 675 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YDR154CYDR154C 351 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 RML2YEL050C 1182 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 ORM1YGR038W 669 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 TOM20YGR082W 552 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YJL107CYJL107C 1164 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 ECM19YLR390W 339 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 ARO7YPR060C 771 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YPR195CYPR195C 330 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 HAP1YLR256W 4509 nt4.81□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 MDH3YDL078C 1032 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 SPO7YAL009W 780 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 RPA49YNL248C 1248 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 LEM3YNL323W 1245 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 snR10snR10 245 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 ODC2YOR222W 924 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 ECM3YOR092W 1842 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YHR045WYHR045W 1683 nt4.8□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 RRN3YKL125W 1884 nt4.79□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YGL072CYGL072C 360 nt4.79□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 PAN6YIL145C 930 nt4.79□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 DBF4YDR052C 2115 nt4.79□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 VMS1YDR049W 1899 nt4.79□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 QRI1YDL103C 1434 nt4.79□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 RNR3YIL066C 2610 nt4.78□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 PUF3YLL013C 2640 nt4.78□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 FET3YMR058W 1911 nt4.78□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 CTS1YLR286C 1689 nt4.78□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 YDL144CYDL144C 1071 nt4.78□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 RPO26YPR187W 468 nt4.78□□□□□ -1.64
TIR4Q12218 FLC3YGL139W 2409 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 NPL6YMR091C 1308 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 HES1YOR237W 1305 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 MSS116YDR194C 1995 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 YER187WYER187W 426 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 XPT1YJR133W 630 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 RPS19BYNL302C 435 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 SCO1YBR037C 888 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 SUE1YPR151C 621 nt4.77□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 KIP2YPL155C 2121 nt4.76□□□□□ -1.65
TIR4Q12218 YMR155WYMR155W 1644 nt4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.8 ms