Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLEQ07864 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLEQ07864 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLEQ07864 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLEQ07864 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLEQ07864 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLEQ07864 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLEQ07864 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLEQ07864 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLEQ07864 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLEQ07864 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLEQ07864 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLEQ07864 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLEQ07864 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLEQ07864 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLEQ07864 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLEQ07864 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLEQ07864 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLEQ07864 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLEQ07864 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLEQ07864 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLEQ07864 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLEQ07864 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLEQ07864 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLEQ07864 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLEQ07864 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLEQ07864 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLEQ07864 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLEQ07864 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLEQ07864 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLEQ07864 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLEQ07864 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLEQ07864 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLEQ07864 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLEQ07864 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLEQ07864 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLEQ07864 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLEQ07864 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLEQ07864 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLEQ07864 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLEQ07864 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLEQ07864 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLEQ07864 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLEQ07864 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLEQ07864 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLEQ07864 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLEQ07864 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLEQ07864 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLEQ07864 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLEQ07864 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLEQ07864 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms