Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX4Q06945 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOX4Q06945 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms