Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A2Q05940 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A2Q05940 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A2Q05940 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms