Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAP2Q03519 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAP2Q03519 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAP2Q03519 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms