Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM4P67936 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM4P67936 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM4P67936 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM4P67936 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM4P67936 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM4P67936 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM4P67936 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM4P67936 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM4P67936 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM4P67936 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM4P67936 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM4P67936 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM4P67936 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM4P67936 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM4P67936 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM4P67936 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM4P67936 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM4P67936 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM4P67936 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM4P67936 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM4P67936 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM4P67936 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM4P67936 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM4P67936 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM4P67936 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM4P67936 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM4P67936 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM4P67936 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM4P67936 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM4P67936 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM4P67936 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM4P67936 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM4P67936 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM4P67936 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms