Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAG2P55895 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAG2P55895 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAG2P55895 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAG2P55895 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAG2P55895 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAG2P55895 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAG2P55895 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAG2P55895 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAG2P55895 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAG2P55895 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAG2P55895 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAG2P55895 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAG2P55895 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAG2P55895 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAG2P55895 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAG2P55895 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAG2P55895 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAG2P55895 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAG2P55895 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAG2P55895 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAG2P55895 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAG2P55895 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAG2P55895 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms