Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 PYC1YGL062W 3537 nt5.71□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YML082WYML082W 1950 nt5.71□□□□□ -1.49
SEC28P40509 HSP104YLL026W 2727 nt5.71□□□□□ -1.49
SEC28P40509 HSF1YGL073W 2502 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 CST6YIL036W 1764 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 PRP40YKL012W 1752 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 SEC20YDR498C 1152 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 RPL12AYEL054C 498 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 YHR095WYHR095W 495 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 YLR317WYLR317W 435 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 GFD1YMR255W 567 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 SCP1YOR367W 603 nt5.71□□□□□ -1.5
SEC28P40509 DFM1YDR411C 1026 nt5.7□□□□□ -1.5
SEC28P40509 CSG2YBR036C 1233 nt5.7□□□□□ -1.5
SEC28P40509 MLC2YPR188C 492 nt5.7□□□□□ -1.5
SEC28P40509 MTC5YDR128W 3447 nt5.7□□□□□ -1.5
SEC28P40509 MRK1YDL079C 1506 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ABZ1YNR033W 2364 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 UPS3YDR185C 540 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 EAF5YEL018W 840 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 RRP4YHR069C 1080 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 YLR126CYLR126C 756 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 YNL194CYNL194C 906 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ELC1YPL046C 300 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 RPS9AYPL081W 594 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ATG12YBR217W 561 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 VAN1YML115C 1608 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 BSC5YNR069C 1470 nt5.69□□□□□ -1.5
SEC28P40509 SRV2YNL138W 1581 nt5.68□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ENV9YOR246C 993 nt5.68□□□□□ -1.5
SEC28P40509 LYS21YDL131W 1323 nt5.68□□□□□ -1.5
SEC28P40509 PRS2YER099C 957 nt5.67□□□□□ -1.5
SEC28P40509 CSM2YIL132C 642 nt5.67□□□□□ -1.5
SEC28P40509 NUD1YOR373W 2556 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 UGO1YDR470C 1509 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ATO3YDR384C 828 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 SIP2YGL208W 1248 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 CTR2YHR175W 570 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 MED4YOR174W 855 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 MCM6YGL201C 3054 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ISN1YOR155C 1353 nt5.66□□□□□ -1.5
SEC28P40509 YIR007WYIR007W 2295 nt5.65□□□□□ -1.5
SEC28P40509 VMA13YPR036W 1437 nt5.65□□□□□ -1.5
SEC28P40509 MPP10YJR002W 1782 nt5.65□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ALD6YPL061W 1503 nt5.65□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ROG3YFR022W 2202 nt5.65□□□□□ -1.5
SEC28P40509 ASP1YDR321W 1146 nt5.65□□□□□ -1.5
SEC28P40509 RPS15YOL040C 429 nt5.65□□□□□ -1.5
SEC28P40509 PRP46YPL151C 1356 nt5.65□□□□□ -1.51
SEC28P40509 OXP1YKL215C 3861 nt5.65□□□□□ -1.51
SEC28P40509 PTK2YJR059W 2457 nt5.65□□□□□ -1.51
SEC28P40509 AMA1YGR225W 1782 nt5.65□□□□□ -1.51
SEC28P40509 APE1YKL103C 1545 nt5.64□□□□□ -1.51
SEC28P40509 QDR3YBR043C 2070 nt5.64□□□□□ -1.51
SEC28P40509 HCR1YLR192C 798 nt5.64□□□□□ -1.51
SEC28P40509 HIR1YBL008W 2523 nt5.64□□□□□ -1.51
SEC28P40509 HOF1YMR032W 2010 nt5.64□□□□□ -1.51
SEC28P40509 TUL1YKL034W 2277 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 YCL065WYCL065W 369 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 YEA6YEL006W 1008 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 COS6YGR295C 1146 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 SPO7YAL009W 780 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 SFC1YJR095W 969 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 PDR16YNL231C 1056 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 RBD2YPL246C 789 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 YEF1YEL041W 1488 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 RAD53YPL153C 2466 nt5.63□□□□□ -1.51
SEC28P40509 GYP1YOR070C 1914 nt5.62□□□□□ -1.51
SEC28P40509 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.62□□□□□ -1.51
SEC28P40509 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.62□□□□□ -1.51
SEC28P40509 RPS16BYDL083C 432 nt5.62□□□□□ -1.51
SEC28P40509 YRA1YDR381W 681 nt5.62□□□□□ -1.51
SEC28P40509 ENT2YLR206W 1842 nt5.62□□□□□ -1.51
SEC28P40509 PUF3YLL013C 2640 nt5.61□□□□□ -1.51
SEC28P40509 SSK22YCR073C 3996 nt5.61□□□□□ -1.51
SEC28P40509 MDH3YDL078C 1032 nt5.61□□□□□ -1.51
SEC28P40509 PAN6YIL145C 930 nt5.61□□□□□ -1.51
SEC28P40509 YMD8YML038C 1329 nt5.61□□□□□ -1.51
SEC28P40509 ADD37YMR184W 597 nt5.61□□□□□ -1.51
SEC28P40509 CDS1YBR029C 1374 nt5.61□□□□□ -1.51
SEC28P40509 ASK1YKL052C 879 nt5.6□□□□□ -1.51
SEC28P40509 MID2YLR332W 1131 nt5.6□□□□□ -1.51
SEC28P40509 MTF1YMR228W 1026 nt5.6□□□□□ -1.51
SEC28P40509 TBF1YPL128C 1689 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 TEF1YPR080W 1377 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 TEF2YBR118W 1377 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 SKI6YGR195W 741 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 SHP1YBL058W 1272 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 NRM1YNR009W 750 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 PSH1YOL054W 1221 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 UIP4YPL186C 915 nt5.59□□□□□ -1.51
SEC28P40509 BUD14YAR014C 2130 nt5.59□□□□□ -1.52
SEC28P40509 SNT2YGL131C 4212 nt5.59□□□□□ -1.52
SEC28P40509 RTT103YDR289C 1230 nt5.58□□□□□ -1.52
SEC28P40509 URA3YEL021W 804 nt5.58□□□□□ -1.52
SEC28P40509 PHM8YER037W 966 nt5.58□□□□□ -1.52
SEC28P40509 RFA2YNL312W 822 nt5.58□□□□□ -1.52
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