Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 CIN4YMR138W 576 nt5.44□□□□□ -1.54
SEF1P34228 RPC19YNL113W 429 nt5.44□□□□□ -1.54
SEF1P34228 UBX2YML013W 1755 nt5.44□□□□□ -1.54
SEF1P34228 RNR3YIL066C 2610 nt5.44□□□□□ -1.54
SEF1P34228 PTK2YJR059W 2457 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 TAH18YPR048W 1872 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 AMA1YGR225W 1782 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YGL235WYGL235W 537 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 CBP4YGR174C 513 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MOD5YOR274W 1287 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 DAP1YPL170W 459 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 ATG12YBR217W 561 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 ICE2YIL090W 1476 nt5.43□□□□□ -1.54
SEF1P34228 PRI2YKL045W 1587 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 PUF3YLL013C 2640 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 HST4YDR191W 1113 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 RPL12AYEL054C 498 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 DAL3YIR032C 588 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YOL035CYOL035C 303 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MRPS5YBR251W 924 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 GUD1YDL238C 1470 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 OXP1YKL215C 3861 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MKK2YPL140C 1521 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 FLC3YGL139W 2409 nt5.42□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 VAM7YGL212W 951 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 BCY1YIL033C 1251 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YIR042CYIR042C 711 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YKL107WYKL107W 930 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MRPL22YNL177C 930 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 DSE3YOR264W 1293 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 YPR114WYPR114W 948 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 KTR3YBR205W 1215 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MRK1YDL079C 1506 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 CST6YIL036W 1764 nt5.41□□□□□ -1.54
SEF1P34228 CLB2YPR119W 1476 nt5.4□□□□□ -1.54
SEF1P34228 ADY2YCR010C 852 nt5.4□□□□□ -1.54
SEF1P34228 MRPL1YDR116C 858 nt5.4□□□□□ -1.54
SEF1P34228 ASP1YDR321W 1146 nt5.4□□□□□ -1.54
SEF1P34228 LEU5YHR002W 1074 nt5.4□□□□□ -1.54
SEF1P34228 NAT5YOR253W 531 nt5.4□□□□□ -1.54
SEF1P34228 EIS1YMR031C 2532 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 CTS2YDR371W 1536 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 PDE1YGL248W 1110 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 EFM4YIL064W 774 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 MRP17YKL003C 396 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ICT1YLR099C 1185 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 PNP1YLR209C 936 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 OSW5YMR148W 447 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ADD37YMR184W 597 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ROG3YFR022W 2202 nt5.39□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ALD6YPL061W 1503 nt5.38□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ERG7YHR072W 2196 nt5.38□□□□□ -1.55
SEF1P34228 AAD6YFL056C 639 nt5.38□□□□□ -1.55
SEF1P34228 SEC13YLR208W 894 nt5.38□□□□□ -1.55
SEF1P34228 YLR296WYLR296W 327 nt5.38□□□□□ -1.55
SEF1P34228 AAD15YOL165C 432 nt5.38□□□□□ -1.55
SEF1P34228 FRE7YOL152W 1863 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 RAD24YER173W 1980 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 MMS2YGL087C 414 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 LDB18YLL049W 540 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 HAP3YBL021C 435 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 KKQ8YKL168C 2175 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 VPS70YJR126C 2436 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 APE1YKL103C 1545 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 VBA1YMR088C 1689 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 DBP9YLR276C 1785 nt5.37□□□□□ -1.55
SEF1P34228 SYN8YAL014C 768 nt5.36□□□□□ -1.55
SEF1P34228 NPA3YJR072C 1158 nt5.36□□□□□ -1.55
SEF1P34228 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.36□□□□□ -1.55
SEF1P34228 YFL042CYFL042C 2025 nt5.36□□□□□ -1.55
SEF1P34228 VPS5YOR069W 2028 nt5.36□□□□□ -1.55
SEF1P34228 MPP10YJR002W 1782 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 SLD2YKL108W 1362 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 IMG2YCR071C 441 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 RPT3YDR394W 1287 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 YGR022CYGR022C 330 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 SKG1YKR100C 1068 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 MID2YLR332W 1131 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ARG1YOL058W 1263 nt5.35□□□□□ -1.55
SEF1P34228 LCB2YDR062W 1686 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 RKM4YDR257C 1485 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ATG4YNL223W 1485 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 PHB1YGR132C 864 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 VMA16YHR026W 642 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 UBC11YOR339C 471 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 YPL014WYPL014W 1146 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 ERI1YPL096C-A 207 nt5.34□□□□□ -1.55
SEF1P34228 PRT1YOR361C 2292 nt5.34□□□□□ -1.56
SEF1P34228 GAT1YFL021W 1533 nt5.33□□□□□ -1.56
SEF1P34228 NUD1YOR373W 2556 nt5.33□□□□□ -1.56
SEF1P34228 SPO77YLR341W 1434 nt5.33□□□□□ -1.56
SEF1P34228 CLD1YGR110W 1338 nt5.33□□□□□ -1.56
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