Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPAP23025 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPAP23025 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPAP23025 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPAP23025 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
XPAP23025 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPAP23025 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPAP23025 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPAP23025 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPAP23025 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPAP23025 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPAP23025 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPAP23025 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XPAP23025 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XPAP23025 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPAP23025 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPAP23025 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPAP23025 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPAP23025 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPAP23025 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPAP23025 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPAP23025 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPAP23025 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPAP23025 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XPAP23025 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPAP23025 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPAP23025 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPAP23025 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPAP23025 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPAP23025 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPAP23025 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPAP23025 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPAP23025 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPAP23025 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPAP23025 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPAP23025 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPAP23025 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPAP23025 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPAP23025 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPAP23025 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2414.7 ms