Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB4P21439 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB4P21439 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB4P21439 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB4P21439 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms