Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT10P13645 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT10P13645 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT10P13645 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT10P13645 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT10P13645 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT10P13645 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT10P13645 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT10P13645 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT10P13645 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT10P13645 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT10P13645 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT10P13645 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT10P13645 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT10P13645 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT10P13645 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT10P13645 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT10P13645 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT10P13645 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT10P13645 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT10P13645 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT10P13645 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT10P13645 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT10P13645 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT10P13645 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT10P13645 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT10P13645 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT10P13645 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT10P13645 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT10P13645 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT10P13645 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT10P13645 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT10P13645 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT10P13645 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT10P13645 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT10P13645 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT10P13645 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms