Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00271P0C7V0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00271P0C7V0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00271P0C7V0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00271P0C7V0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms