Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2P04141 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF2P04141 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF2P04141 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF2P04141 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2P04141 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2P04141 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2P04141 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2P04141 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2P04141 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2P04141 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2P04141 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2P04141 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2P04141 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2P04141 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2P04141 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2P04141 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2P04141 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2P04141 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2P04141 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2P04141 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2P04141 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2P04141 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2P04141 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2P04141 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2P04141 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2P04141 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2P04141 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF2P04141 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF2P04141 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2P04141 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2P04141 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2P04141 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms