Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD1O95696 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD1O95696 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD1O95696 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD1O95696 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD1O95696 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD1O95696 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD1O95696 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD1O95696 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD1O95696 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD1O95696 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD1O95696 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD1O95696 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD1O95696 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRD1O95696 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRD1O95696 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD1O95696 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD1O95696 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD1O95696 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD1O95696 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD1O95696 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD1O95696 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD1O95696 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD1O95696 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD1O95696 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD1O95696 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD1O95696 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD1O95696 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD1O95696 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD1O95696 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD1O95696 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD1O95696 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD1O95696 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD1O95696 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD1O95696 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD1O95696 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD1O95696 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD1O95696 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD1O95696 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD1O95696 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRD1O95696 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRD1O95696 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BRD1O95696 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRD1O95696 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRD1O95696 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRD1O95696 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRD1O95696 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRD1O95696 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRD1O95696 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BRD1O95696 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BRD1O95696 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BRD1O95696 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRD1O95696 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRD1O95696 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRD1O95696 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRD1O95696 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRD1O95696 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRD1O95696 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRD1O95696 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms