Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL3O95236 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL3O95236 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOL3O95236 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOL3O95236 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOL3O95236 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOL3O95236 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOL3O95236 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOL3O95236 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOL3O95236 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOL3O95236 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOL3O95236 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOL3O95236 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOL3O95236 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOL3O95236 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOL3O95236 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOL3O95236 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOL3O95236 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOL3O95236 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOL3O95236 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOL3O95236 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOL3O95236 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOL3O95236 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOL3O95236 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOL3O95236 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APOL3O95236 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOL3O95236 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOL3O95236 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOL3O95236 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOL3O95236 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOL3O95236 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOL3O95236 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms