Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6AO75865 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC6AO75865 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC6AO75865 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms