Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRDM1O75626 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM1O75626 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM1O75626 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.6 ms