Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM1AO60341 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM1AO60341 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms