Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SPAG9O60271 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SPAG9O60271 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SPAG9O60271 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms