Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX1O43812 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX1O43812 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUX1O43812 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUX1O43812 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUX1O43812 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX1O43812 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX1O43812 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX1O43812 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX1O43812 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX1O43812 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX1O43812 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX1O43812 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX1O43812 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX1O43812 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX1O43812 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX1O43812 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUX1O43812 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUX1O43812 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DUX1O43812 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX1O43812 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX1O43812 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX1O43812 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX1O43812 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX1O43812 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX1O43812 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX1O43812 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX1O43812 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX1O43812 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUX1O43812 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUX1O43812 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUX1O43812 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUX1O43812 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUX1O43812 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUX1O43812 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUX1O43812 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUX1O43812 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUX1O43812 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX1O43812 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX1O43812 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX1O43812 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX1O43812 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX1O43812 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms