Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B1O43520 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms