Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLRMTO00411 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLRMTO00411 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
POLRMTO00411 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
POLRMTO00411 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms