Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
SUPT5HO00267 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
SUPT5HO00267 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SUPT5HO00267 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms