Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QQQ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QQQ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QQQ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QQQ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QQQ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QQQ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QQQ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QQQ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QQQ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QQQ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QQQ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QQQ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QQQ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QQQ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QQQ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QQQ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QQQ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QQQ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QQQ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QQQ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QQQ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QQQ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QQQ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QQQ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms