Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM223A0PJW6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM223A0PJW6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms