Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUV0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUV0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUV0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUV0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUV0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms