Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-323■■■■■ 132.9
PUM2Q8TB72 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.891e-323■■■■■ 132.9
PUM2Q8TB72 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -11e-323■■■■■ 132.9
PUM2Q8TB72 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-323■■■■■ 132.9
PUM2Q8TB72 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.441e-323■■■■■ 132.9
PUM2Q8TB72 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 WDR61-203ENST00000558412 927 ntTSL 29.74□□□□□ -0.852e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 WDR61-207ENST00000559332 844 ntTSL 38.63□□□□□ -1.032e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 WDR61-214ENST00000560807 789 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 WDR61-210ENST00000559940 3629 nt6.28□□□□□ -1.42e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.462e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 WDR61-204ENST00000558453 463 ntTSL 54.56□□□□□ -1.682e-16■■■■■ 132.7
PUM2Q8TB72 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-18■■■■■ 130.8
PUM2Q8TB72 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-18■■■■■ 130.8
PUM2Q8TB72 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.352e-8■■■■■ 130.4
PUM2Q8TB72 RBM23-202ENST00000346528 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.694e-12■■■■■ 128.3
PUM2Q8TB72 RBM23-215ENST00000555209 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.774e-12■■■■■ 128.3
PUM2Q8TB72 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-12■■■■■ 128.3
PUM2Q8TB72 RBM23-233ENST00000557667 4240 ntTSL 1 (best)8.1□□□□□ -1.114e-12■■■■■ 128.3
PUM2Q8TB72 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.264e-12■■■■■ 128.3
PUM2Q8TB72 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 314.87□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 126.4
PUM2Q8TB72 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.024e-15■■■■■ 125.7
PUM2Q8TB72 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.024e-15■■■■■ 125.7
PUM2Q8TB72 SNRNP25-201ENST00000293861 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.68■□□□□ 0.95e-29■■■■■ 124.4
PUM2Q8TB72 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.725e-29■■■■■ 124.4
PUM2Q8TB72 SNRNP25-203ENST00000397876 831 ntTSL 312.89□□□□□ -0.355e-29■■■■■ 124.4
PUM2Q8TB72 SNRNP25-206ENST00000481947 1260 ntTSL 511.32□□□□□ -0.65e-29■■■■■ 124.4
PUM2Q8TB72 SNRNP25-205ENST00000466183 1130 ntTSL 27.74□□□□□ -1.175e-29■■■■■ 124.4
PUM2Q8TB72 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.45e-10■■■■■ 123.9
PUM2Q8TB72 POR-222ENST00000493973 1028 ntTSL 215.76■□□□□ 0.115e-10■■■■■ 123.9
PUM2Q8TB72 POR-216ENST00000454934 2295 ntTSL 315.68■□□□□ 0.15e-10■■■■■ 123.9
PUM2Q8TB72 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 123.9
PUM2Q8TB72 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.035e-10■■■■■ 123.9
PUM2Q8TB72 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-10■■■■■ 123
PUM2Q8TB72 JADE1-211ENST00000512960 3000 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-10■■■■■ 123
PUM2Q8TB72 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11e-10■■■■■ 123
PUM2Q8TB72 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.463e-14■■■■■ 120.8
PUM2Q8TB72 RUSC2-201ENST00000361226 5199 ntAPPRIS P1 TSL 216.8■□□□□ 0.283e-14■■■■■ 120.8
PUM2Q8TB72 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-18■■■■■ 119.7
PUM2Q8TB72 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-18■■■■■ 119.7
PUM2Q8TB72 ASCC2-219ENST00000487486 1596 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-18■■■■■ 119.7
PUM2Q8TB72 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-18■■■■■ 119.7
PUM2Q8TB72 ASCC2-215ENST00000472433 536 ntTSL 311.15□□□□□ -0.622e-18■■■■■ 119.7
PUM2Q8TB72 ASCC2-209ENST00000458594 2753 ntTSL 511.04□□□□□ -0.642e-18■■■■■ 119.7
PUM2Q8TB72 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-323■■■■■ 118.8
PUM2Q8TB72 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.629e-8■■■■■ 117.9
PUM2Q8TB72 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 117.9
PUM2Q8TB72 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.475e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 FLT3LG-210ENST00000600084 1057 ntTSL 1 (best)17.88■□□□□ 0.455e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.25e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 FLT3LG-209ENST00000598555 591 ntTSL 315.28■□□□□ 0.045e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.035e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.045e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 FLT3LG-212ENST00000601800 1032 ntTSL 514.42□□□□□ -0.15e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.185e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.225e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 FLT3LG-203ENST00000594009 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.955e-23■■■■■ 117.5
PUM2Q8TB72 TUSC2-205ENST00000462137 834 ntTSL 320.51■□□□□ 0.873e-11■■■■■ 116.4
PUM2Q8TB72 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.693e-11■■■■■ 116.4
PUM2Q8TB72 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-12■■■■■ 116.3
PUM2Q8TB72 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-12■■■■■ 116.3
PUM2Q8TB72 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.154e-12■■■■■ 116.3
PUM2Q8TB72 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.14e-12■■■■■ 116.3
PUM2Q8TB72 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-12■■■■■ 116.3
PUM2Q8TB72 WDR74-215ENST00000544831 814 ntTSL 213.14□□□□□ -0.314e-12■■■■■ 116.3
PUM2Q8TB72 WDR74-207ENST00000536401 371 ntTSL 39.78□□□□□ -0.844e-12■■■■■ 116.3
PUM2Q8TB72 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 116.2
PUM2Q8TB72 RRAGC-204ENST00000496778 568 ntTSL 56.07□□□□□ -1.449e-26■■■■■ 116.1
PUM2Q8TB72 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.137e-10■■■■■ 115.9
PUM2Q8TB72 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.361e-323■■■■■ 115.4
PUM2Q8TB72 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.021e-323■■■■■ 115.4
PUM2Q8TB72 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-323■■■■■ 115.4
PUM2Q8TB72 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.331e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -01e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 312.58□□□□□ -0.41e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-209ENST00000512466 3763 ntTSL 210.13□□□□□ -0.791e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-208ENST00000511482 878 ntTSL 58.79□□□□□ -11e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 37.46□□□□□ -1.221e-18■■■■■ 114.6
PUM2Q8TB72 MDM1-210ENST00000540418 2507 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.177e-21■■■■■ 113.9
PUM2Q8TB72 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.367e-21■■■■■ 113.9
PUM2Q8TB72 MDM1-202ENST00000357874 393 ntTSL 58.38□□□□□ -1.077e-21■■■■■ 113.9
PUM2Q8TB72 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.727e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.417e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.367e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 RPL29-201ENST00000294189 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.97e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 ZNF507-202ENST00000355898 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.937e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.057e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 RPL29-205ENST00000480306 719 ntTSL 27.98□□□□□ -1.137e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.387e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 ZNF507-205ENST00000587084 5560 ntTSL 1 (best)5.4□□□□□ -1.557e-12■■■■■ 113
PUM2Q8TB72 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.173e-22■■■■■ 112.8
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 423.8 ms