Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.465e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.335e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.245e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 513.49□□□□□ -0.255e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 512.86□□□□□ -0.355e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 412.37□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 512.02□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 54.4
XRCC6P12956 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.979e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.289e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 LAMA5-214ENST00000497363 579 ntTSL 318.44■□□□□ 0.549e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.359e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-209ENST00000511545 608 ntTSL 212.72□□□□□ -0.379e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-208ENST00000511211 566 ntTSL 38.55□□□□□ -1.049e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.159e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.249e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 SNX24-210ENST00000513613 551 ntTSL 45.13□□□□□ -1.599e-13■■■■■ 52.6
XRCC6P12956 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.981e-9■■■■■ 51.7
XRCC6P12956 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-206ENST00000448673 652 ntTSL 59.94□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-203ENST00000421460 352 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 35.98□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 51.3
XRCC6P12956 WWC2-207ENST00000508614 604 ntTSL 319.47■□□□□ 0.716e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.146e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.386e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.446e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-202ENST00000427431 6373 ntTSL 211.93□□□□□ -0.56e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 WWC2-203ENST00000438543 3824 ntTSL 210.37□□□□□ -0.756e-11■■■■■ 50.6
XRCC6P12956 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-9■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 BCL9L-205ENST00000532899 611 ntTSL 517.74■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-202ENST00000372514 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-205ENST00000487556 2988 ntTSL 511.45□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 50.2
XRCC6P12956 PAPD4-211ENST00000508620 483 ntTSL 418.16■□□□□ 0.59e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-215ENST00000514095 575 ntTSL 416.38■□□□□ 0.219e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-207ENST00000504233 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.159e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-217ENST00000515807 576 ntTSL 413.81□□□□□ -0.29e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-201ENST00000296783 3129 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.379e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.479e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-204ENST00000453514 3523 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.569e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-206ENST00000503620 582 ntTSL 38.79□□□□□ -19e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.339e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 PAPD4-209ENST00000505571 781 ntTSL 35.2□□□□□ -1.589e-16■■■■■ 48.9
XRCC6P12956 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 AP000781.2-203ENST00000528835 533 ntTSL 319.05■□□□□ 0.646e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 215.35■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.626e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 SLC43A3-226ENST00000625097 1796 nt8.99□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 48.8
XRCC6P12956 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.011e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.481e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-208ENST00000511088 579 ntTSL 49.48□□□□□ -0.891e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 48.5
XRCC6P12956 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 48.4
XRCC6P12956 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 48.4
XRCC6P12956 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.18□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.192e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.492e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-205ENST00000626262 1753 ntTSL 223.81■■□□□ 1.42e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.172e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 CHD2-217ENST00000629136 480 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 CHD2-206ENST00000625990 888 ntTSL 59.76□□□□□ -0.852e-10■■■■■ 48.3
XRCC6P12956 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.711e-12■■■■■ 48.1
XRCC6P12956 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-12■■■■■ 48.1
XRCC6P12956 PUM2-211ENST00000446940 525 ntTSL 416.33■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 415.44■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 59.46□□□□□ -0.92e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 55.54□□□□□ -1.522e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 55.23□□□□□ -1.572e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 54.88□□□□□ -1.632e-11■■■■■ 47.5
XRCC6P12956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.483e-10■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 416.17■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 225.49■■□□□ 1.677e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-222ENST00000507229 2582 ntTSL 224.86■■□□□ 1.577e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.397e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.387e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.377e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 523.26■■□□□ 1.317e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 522.26■■□□□ 1.157e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.157e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.137e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.087e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.087e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.037e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.927e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 220.32■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 47.1
XRCC6P12956 MIB2-206ENST00000467597 776 ntTSL 220.01■□□□□ 0.797e-9■■■■■ 47.1
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