Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
U3KQE9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
U3KQE9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
U3KQE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
U3KQE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
U3KQE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
U3KQE9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
U3KQE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
U3KQE9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
U3KQE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
U3KQE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
U3KQE9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
U3KQE9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
U3KQE9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
U3KQE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
U3KQE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
U3KQE9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
U3KQE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms