Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN16Q9Y5I7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms