Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UTP11Q9Y3A2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UTP11Q9Y3A2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTP11Q9Y3A2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP11Q9Y3A2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms