Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS9D1Q9Y2B5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS9D1Q9Y2B5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms