Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC6Q9Y210 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC6Q9Y210 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC6Q9Y210 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms