Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLEC4AQ9UMR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4AQ9UMR7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms