Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACKR4Q9NPB9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms