Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDFQ9HBH1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms