Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF1Q9BYJ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YTHDF1Q9BYJ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms