Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC106Q9BWC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC106Q9BWC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC106Q9BWC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms