Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMED9Q9BVK6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMED9Q9BVK6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms