Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF649Q9BS31 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZNF649Q9BS31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms