Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRG3Q99928 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRG3Q99928 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms